辦理租賃合同登記對于當事人來說相當重要，因為租賃行為雖然是一種平等主體之間的民事行為，政府行政管理不宜過多干涉。但其行為客體———房屋卻是一種特殊商品，與國土資源、人口、居住以及社會治安、環境保護密切相關，從而提出了對出租的房屋進行合法性審查的必要。
“買賣不破租賃”雖然作為一項立法原則為各國立法所確立，但如何讓新的買受人預先知道房屋存在租賃的事實，以減少風險并增加公平交易的機會，也是立法所應當考慮的。正是基于維護社會公平和市場交易秩序的理由，產生了對房屋租賃行為進行登記之需求———只有經過登記的房屋租賃行為，才受法律的保護，才能對抗第三人，否則，就不受法律保護，也不能對抗第三人。
房屋租賃關系會產生一些權利，改變優先承租權和優先購買權，經過登記的合同證據效力大于未登記的;由于合同登記管理機關審查房產證明和雙方身份證，很大程度上保護承租人的權利，如有的設置了抵押權則起到提醒承租人的作用，可更好地保護承租人的利益。
曾有這樣一個案例：羅湖某大廈業主與承租人簽訂一份商鋪租賃合同，約定了很高的租金，不是在主合同上約定，而是在附合同上約定，主合同和附合同都辦理了合同登記。之后，承租人住進去了就不付租金，并將附合同抽掉其中的幾頁，但看起來還是相對完整的，認為租金約定不明。發生糾紛后，最后以在管理部門登記的合同為準來付租金，這是因為，當事人進行房屋租賃合同登記時，登記管理機關會有留底合同，這樣可以很好地保護雙方當事人的合法權益。
辦理合同登記，依法納入管理后會享受很多后續的好處，未辦登記是違法行為，辦了登記發生糾紛后可由房屋租賃管理部門協調處理，起到很好的效果，且不辦理登記還可能承擔法律后果，不僅是在租賃部門，稅務部門也可對其偷逃稅作出處罰。
